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생물학4

Primer design (프라이머 디자인) PCR이 잘 진행되려면 제일 중요한,프라이머 디자인. Primer design을 하기 위한 방법은 다음과 같다.1. Primer mer 수 (Primer의 길이)일반적으로 18~25mer로 구성한다.너무 짧으면 비특이적 결합 가능성 증가.너무 길면 결합 효율 감소.2. GC함량 (GC content)GC content는 40~60%가 이상적.3. Tm 값 (Melting temperature)Tm ≈ 55~65°C가 이상적Forward와 Reverse 프라이머의 Tm은 ±2°C 이내로 맞추는 게 좋음Tm 계산 공식 (간단한 방법):Tm ≈ 2°C × (A+T) + 4°C × (G+C)4. 3' 말단* 3' 말단에 G 또는 C를 두면 Primer와 Template DNA의 안정적인 결합에 도움을 줌(GC .. 2025. 4. 16.
PCR (Polymerase Chain Reaction) ; 중합효소연쇄반응 원리 PCR (Polymerase Chain Reaction)PCR(Polymerase Chain Reaction, 중합효소연쇄반응)은 원하는 Target DNA 서열을 primer를 사용해 증폭하는 분자생물학적 기술이다. 아주 적은 양의 DNA 샘플을 사용하더라도 원하는 부분을 수백만배 이상 증폭가능하기에 유전자연구, 질병 진단, 법의학 등의 분야에서 사용된다.PCR의 기본 원리PCR은 세 단계의 온도 사이클을 반복하면서 DNA를 증폭한다.1. 변성(Denaturation)약 94~98°C에서 이중 나선 구조의 DNA를 단일 가닥으로 분리2. 접합(Annealing)약 50~65°C에서 프라이머(primer)라고 불리는 짧은 DNA 조각이 Target DNA에 결합3. 신장(Extension/Elongati.. 2025. 4. 16.
실험노트, 연구노트 작성방법 및 양식 연구노트란? [국가연구개발사업 연구노트 지침] 제 2조 제4호에 따르면, 연구노트란 연구개발과제 수행을 통해 얻은 정보, 데이터 및 노하우 등을 체계적으로 기록한 자료를 말한다. 연구노트는 전자연구노트, 서면연구노트 외 음성, 영상 등 다양한 형식으로 작성할 수 있다. 연구노트의 기능 연구노트의 기능을 살펴보자면, 개인적 측면으로는 과거의 실험결과를 바탕으로 그 안에서 새로운 아이디어를 얻고자 할 때 다양한 정보를 제공함, 효율적인 연구데이터를 관리할 수 있다는 점 그리고 과거 실험을 재현하기 위해 필요하다고 볼 수 있다. 기관 및 연구실 측면으로는 연구실의 지식과 노하우를 전수하고 연구의 계속성을 유지하는 것 그리고 연구 진도 관리를 위한 기능이 있다. 연구노트의 제작형태 및 내지 구성 연구노트는 삽입.. 2022. 11. 6.
NCBI ; FASTA 형식 NCBI (National Center ofr Biotechnololgy Information)은 미국 국립생물공학정보센터로, 생명공학 & 생명의학과 관련된 데이터베이스를 보유하고 있다. 주요 DB로는 DNA 서열에 대한 GenBank와 논문과 관련하여 PubMed가 있다. NCBI 에서 주로 사용하게 되는 건 DNA 서열 및 단백질 서열을 활용하는 데 사용하는 데, NCBI에서는 DNA 서열 및 단백질 서열을 텍스트 기반으로 나타낸 FASTA 형식으로 제공한다. 2019년 코로나 바이러스 (SARS-CoV-2) 를 예를 들어 살펴보자. NCBI 홈페이지(National Center for Biotechnology Information (nih.gov))에 들어가서 검색창에 SARS-CoV-2를 타이핑 .. 2021. 12. 28.